ร่วมผลิตแพทย์ให้มีความรู้ทางด้านจุลชีววิทยาและเป็นที่ยอมรับในสังคม

ภาควิชาจุลชีววิทยา ได้ก่อตั้งขึ้นพร้อมกับ วิทยาลับแพทยศาสตร์พระมงกุฎเกล้า เมื่อ 16 มิถุนายน พ.ศ. 2518 โดย มีสำนักงานอยู่ที่ชั้น 3 ของสถาบันพยาธิวิิทยา และได้เปิดสอนเป็นครั้งแรกสำหรับนักเรียนแพทย์ทหารรุ่นที่ 1 จำนวน 32 นาย ต่อมาในปี พ.ศ. 2528 ภาควิชาฯ ได้ย้ายที่ทำการมายังอาคารเรียนซึ่งเป็นอาคารสร้างใหม่ ในพื้นที่ของวิทยาลัยฯ โดยมีสำนักงานอยู่ที่ชั้น 4 ของอาารมาจนกระทั่งปัจจุบัน มีผู้ดำรงตำแหน่งหัวหน้าภาควิชาฯ ดังรายนามต่อไปนี้