ในส่วนของการเตรียมตัวในการสอบเข้าเป็นนักเรียนแพทย์ทหารนั้นไม่ได้มีความแตกต่างจากการสอบเพื่อเป็นนักเรียนแพทย์ทั่วไปมากนักจะมีเพียงแต่การเตรียมร่างกายเพื่อการคัดเลือกเข้ารับทุนกองทัพบกและการฝึกในช่วงแรกของชั้นปีที่ 2

คิดว่าสิ่งที่ต่างกันนั้น อย่างแรกคือจุดมุ่งหมายหลังฝึกเสร็จแล้ว ของการฝึกทหาร จะเป็นการฝึกเพื่อให้สามารถไปปฏิบัติหน้าที่ รวมไปถึงสามารถรบที่แนวหน้าได้ สามารถใช้อาวุธยุทโธปกรณ์ทางการทหารได้เป็นอย่างดี ในขณะที่ส่วนของการฝึกแพทย์ทหารนั้น จะเป็นการฝึกแพทย์เพื่อให้สามารถเข้าใจในคำสั่งทางทหารได้ สามารถไปอยู่ช่วยในแนวหลังได้โดยไม่ติดปัญหาอะไรในเวลาที่คับขัน ซึ่งความเข้มข้นทางการฝึกก็จะต่างกัน เพราะการฝึกทหารจะเน้นการฝึกร่างกายเป็นหลัก เน้นศึกษาวิชาทางทหาร ส่วนการฝึกแพทย์ทหารจะเป็นการฝึกที่ไม่ได้เน้นทางร่างกายมากหนักเท่ากับการฝึกทหาร เน้นทางวิชาทางการแพทย์ เพราะแพทย์ต้องมีความรู้ให้มากเพื่อให้สามารถรักษาผู้ป่วยให้หายจากโรคและอาการบาดเจ็บได้